PHÁT HIỆN BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI BẰNG KỸ THUẬT LF-RPA

Bùi Thị Lan Anh1, , Hoàng Đăng Hiếu1, Ngô Thanh Nam1, Đặng Thị Việt Hương1, Nguyễn Ngọc Tân1, Lê Thị Lan Anh1, Võ Viết Cường1, P.R CHIRSKOV2, I.B ZAKHAROVA2
1 Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga
2 Viện Phòng chống dịch hạch Volgorgad, Liên bang Nga
Tác giả liên hệ:
Bùi Thị Lan Anh
Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

The application of the LF-RPA molecular biology technique for the rapid and accurate detection of Burkholderia pseudomallei, the causative agent of melioidosis in Vietnam, is essential. This method provided rapid results within 15 to 25 minutes, involved straightforward experimental procedures, and allowed the storage of biological products at room temperature. Additionally, it did not require PCR equipment or a modern laboratory system, and the results could be easily observed with the naked eye. The LF-RPA technique demonstrated 100% sensitivity and specificity in detecting B. pseudomallei. The detection limit of the LF-RPA test was 68.8 fg/μL of bacterial DNA or 10 CFU per 300 μL. DNA was directly extracted from soil samples with low purity, which is a key advantage for applying LF-RPA and LAMP techniques in mountainous regions and islands, where modern laboratories are unavailable or in cases where field testing is necessary.

Chi tiết bài viết

Tài liệu tham khảo

1. James D., Simon S., Enzo B., William J. M., Bart J. C., Josh H., The epidemiology and clinical features of melioidosis in Far North Queensland: Implications for patient management, PLoS Negl Trop Dis, 2017, 11(3):e0005411. DOI: 10.1371/journal.pntd.0005411.
2. Wiersinga, W. J., et al., Melioidosis, Nature Reviews Disease Primers, 2018, 4(1):17107.
3. Currie B. J., Melioidosis: an important cause of pneumonia in residents of and travellers returned from endemic regions, Eur. Respir. J., 2003, 22(3):542-50. DOI: 10.1183/09031936.03.00006203.
4. Bùi Thị Lan Anh, Phạm Thị Hà Giang, Lê Thị Lan Anh, Võ Viết Cường, Phạm Việt Hùng, Quế Anh Trâm, Irina Zakharova, Dmitry Viktorov, Phát triển và đánh giá độ nhạy và độ đặc hiệu của kỹ thuật PCR và LAMP trong việc phát hiện Burkholderia pseudomallei, Tạp chí Y học Dự phòng, 2020, 3:55-62. DOI: https://doi.org/10.51403/0868-2836/2020/261.
5. Rosser A., Rollinson D., Forrest M., Webster B. L., Isothermal Recombinase Polymerase amplification (RPA) of Schistosoma haematobium ADN and oligochromatographic lateral flow detection, Parasit Vectors, 2015, 8:446. DOI: https://doi.org/10.1186/s13071-015-1055-3.
6. Vasileva Wand N. I., Bonney L. C., Watson R. J., Graham V., Hewson R., Point-of-care diagnostic assay for the detection of Zika virus using the recombinase polymerase amplification method, J. Gen. Virol., 2018, 99(8):1012-1026. DOI: https://doi.org/10.1099/jgv.0.001083.
7. Castellanos-Gonzalez A., White A. C., Jr., Melby P., Travi B., Molecular diagnosis of protozoan parasites by Recombinase Polymerase Amplification, Acta Tropica, 2018, 182:4-11. DOI: https://doi.org/10.1016/j.actatropica.2018.02.002.
8. Yao Peng, Xiao Zheng, Biao Kan, Wei Li, Wen Zhang, Taozhen Jiang, Jinxing Lu, Aiping Qin., Rapid detection of Burkholderia pseudomallei with a lateral flow recombinase polymerase amplification assay, PLoS One, 2019, 14(7):e0213416. DOI: 10.1371/journal.pone.0213416.
9. Wu H., Zhao P., Yang X., Li J., Zhang J., Zhang X., A recombinase polymerase amplification and lateral flow strip combined method that detects salmonella enterica serotype typhimurium with no worry of primer-dependent artifacts, Front. Microbiol., 2020, 11(1015). DOI: 10.3389/fmicb.2020.01015.
10. Jaroenram W., Kiatpathomchai W., Flegel T. W., Rapid and sensitive white spot syndrome virus detection by loop-mediated isothermal amplification combined with a lateral flow dipstick, Mol. Cell. Probes., 2009, 23(2):65-70. DOI: 10.1016/j.mcp.2008.12.003.
11. Zakharova I., Teteryatnikova N., Toporkov A., Viktorov D., Development of a multiplex PCR assay for the detection and differentiation of Burkholderia pseudomallei, Burkholderia mallei, Burkholderia thailandensis, and Burkholderia cepacia complex, Acta Tropica, 2017, 174:1. DOI: 10.1016/j.actatropica.2017.06.016.
12. Bùi Thị Lan Anh, Ngô Thanh Nam, Dương Tuấn Linh. Phát hiện và phân loại Burkholderia spp. từ mẫu đất Nghệ An, Tạp chí Khoa học và Công nghệ nhiệt đới, 2017, 13:174-176. DOI:10.58334/vrtc.jtst.n13.20.
13. McHugh M. L., Interrater reliability: the kappa statistic, Biochem. Med. (Zagreb), 2012, 22(3):276-82. DOI:10.11613/BM.2012.031.
14. Wongsuvan G., Limmathurotsakul D., Wannapasni S., et al., Lack of correlation of Burkholderia pseudomallei quantities in blood, urine, sputum and pus, Southeast Asian J. Trop. Med. Public Health, 2009, 40(4):781-4.
15. Najomtien P., Phoksawat W., Khammanthoon S., Klasuk W., Srisurat N., Chattagul S., Photisap C., Pipattanaboon C., Sermswan R. W., PCR combined with lateral flow dipstick assay (PCR-LFD) for a rapid diagnosis of melioidosis, Asian Pac. J. Allergy Immunol., 2024, DOI: https://doi.org/10.12932/ap-021023-1703.
16. Dance D. A., Limmathurotsakul D., Global burden and challenges of melioidosis, Trop. Med. Infect. Dis., 2018, 3(1):13. DOI: 10.3390/tropicalmed3010013.