NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN ENTEROVIRUS LƯU HÀNH TẠI VIỆT NAM
Tác giả liên hệ:
Vu T. L.
Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga
Vũ Thị Loan Viện Y sinh Nhiệt đới, Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga Số 63 Nguyễn Văn Huyên, Nghĩa Đô, Cầu Giấy, Hà Nội
Số điện thoại: 0981791148; Email: vtloan194@gmail.com
Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga
Vũ Thị Loan Viện Y sinh Nhiệt đới, Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga Số 63 Nguyễn Văn Huyên, Nghĩa Đô, Cầu Giấy, Hà Nội
Số điện thoại: 0981791148; Email: vtloan194@gmail.com
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
STUDY OF THE GENETIC DIVERSITY OF ENTEROVIRUSES CIRCULATING IN THE SOCIALIST REPUBLIC OF VIETNAM
Molecular genetic studies of 221 strains of enteroviruses isolated from patients with HFMD and neuroinfections from different provinces of Vietnam in 2018-2021 were carried out. 20 types of enteroviruses have been identified: CVA2, CVA4, CVA5, CVA6, CVA8, CVA10, CVA16, EV-A71, CVA9, CVB1, CVB2, CVB4, ECHO4, ECHO6, ECHO9, ECHO11, ECHO16, ECHO29, ECHO25, ECHO30. Genetic heterogeneity of Vietnamese enterovirus strains has been established.
Từ khóa
Enteroviruses, genotypes, circulation monitoring, bệnh tay chân miệng, nhiễm trùng do Enterovirus
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
1. Zell R., Delwart E., Gorbalenya A. E., et al., ICTV virus taxonomy profile: picornaviridae, J. Gen. Virol., 2017, 98(10):2421-2422.
2. Nguyen T. T. T., Donato C., Trang V. T. H., Kien N. T., Trang P. M. M. T., Khanh T. Q., Nguyet D. T., Sessions O. M., Cuong H. Q., Lan P. T., Huong V. T. Q., Van Doorn H. R., Vijaykrishna D., Evolution and Spatiotemporal Dynamics of Enterovirus A71 Subgenogroups in Vietnam, J. Infect. Dis., 2017, 216(11):1371-1379.
3. Le Nguyen Thanh Nhan, et al., Clinical, etiological and epidemiological investigations of hand, foot and mouth disease in southern Vietnam during 2015-2018, PLoS neglected tropical diseases, 2020, 14(8):e0008544.
4. Puenpa J., Auphimai C., Korkong S., Vongpunsawad S., Poovorawan Y., Enterovirus A71 Infection, Thailand, 2017, Emerg. Infect. Dis., 2018, 24(7):1386-1387.
5. Thoa Le P. K., Chiang P. S., Khanh T. H., Luo S. T., Dan T. N., Wang Y. F., Thuong T. C., Chung W. Y., Hung N. T., Wang J. R., Nhan Le N. T., Thinh Le Q., Su I. J., Dung T. D., Lee M. S., Genetic and antigenic characterization of enterovirus 71 in Ho Chi Minh City, Vietnam, PLoS One, 2013, 8(7):1-6.
6. Nix W. A., Oberste M. S., Pallansch M. A., Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens, J. Clin. Microbiol., 2006, 44:2698-2704.
7. Голицына Л. Н., Патент № 2743352 Российская Федерация, Способ дифференциальной амплификации фрагмента области VP1 генома энтеровирусов видов Enterovirus A и Enterovirus B, № 2020117726: заявл. 19.05.2020: опубл. 17.02.2021, Правообладатель ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора, Бюллетень ФИПС «Изобретения. Полезные модели», 2021 г., № 5.
8. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S., MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods, Mol. Biol. Evol., 2011, 28:273-2739.
9. Drummond A. J., Suchard M. A., Xie D., Rambaut A., Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7., Mol. Biol. Evol., 2012, 29(8):1969-73.
10. Голицына Л. Н., Зверев В. В., Парфенова О. В., Епифанова Н. В., Сашина Т. А., Кашников А. Ю., Григорьева Г. И., Новикова Н. А., Вирус Коксаки А6 в Российской Федерации в 2014 году, Дальневосточный журнал инфекционной патологии, 2015, 28:12-20.
11. Anh N. T., Nhu L. N. T., Van H. M. T., Hong N. T. T, Than T. T., Hang V. T. T., Ny N. T. H., Nguyet L. A., Phuong T. T. L., Nhan L. N. T., Hung N. T., Khan T. H., Tuan H. M., Viet H. L., Nam N. T., Viet D. C., Qui P. T., Wills B., Sabanathan S., Chau N. V. V., Thwaites L., Van Doorn H. R., Thwaites G., Rabaa M. A., Tan L. V., Emerging Coxsackievirus A6 causing hand foot and mouth disease, Vietnam, Emerg. Infect. Dis., 2018, 24(4):654-661.
12. Hoa-Tran T. N., Dao A. T. H., Nguyen A. T., Kataoka C., Takemura T., Pham C. H., Vu H. M., Hong T. T. T., Ha N. T. V., Duong T. N., Thanh N. T. H., Shimizu H., Coxsackieviruses A6 and A16 associated with hand, foot, and mouth disease in Vietnam, 2008-2017: Essential information for rational vaccine design, Vaccine, 2020, 38(52):8273-8285.
13. Голицына Л. Н., Зверев В. В., Пономарева Н. В., Романенкова Н. И., Нгуен Т. Т. Т., Канаева О. И., Селиванова С. Г., Леонов А. В., Розаева Н. Р., Кашников А. Ю., Бичурина М. А., Новикова Н. А., Молекулярно-эпидемиологический мониторинг циркуляции вируса Коксаки А10, Здоровье населения и среда обитания, 2021 г., 4(337):43-49.
14. Romanenkova L. N. Golitsyna T. T. T. Nguyen N. V., Ponomareva, A. V. Leonov, O. I. Kanaeva, V. V. Zverev, S. G. Selivanova, N. R. Rozaeva, M. A. Bichurina, N.A. Novikova, Epidemiological and etiological aspects of enterovirus infection in Russia and Vietnam, Инфекция и Иммунитет, 2021, 11(5):895-908.
15. Puenpa J., et al., Hand, foot, and mouth disease caused by coxsackievirus A6, Thailand 2012, Emerg. Infect. Dis. 2013, 19(4):641-643.
2. Nguyen T. T. T., Donato C., Trang V. T. H., Kien N. T., Trang P. M. M. T., Khanh T. Q., Nguyet D. T., Sessions O. M., Cuong H. Q., Lan P. T., Huong V. T. Q., Van Doorn H. R., Vijaykrishna D., Evolution and Spatiotemporal Dynamics of Enterovirus A71 Subgenogroups in Vietnam, J. Infect. Dis., 2017, 216(11):1371-1379.
3. Le Nguyen Thanh Nhan, et al., Clinical, etiological and epidemiological investigations of hand, foot and mouth disease in southern Vietnam during 2015-2018, PLoS neglected tropical diseases, 2020, 14(8):e0008544.
4. Puenpa J., Auphimai C., Korkong S., Vongpunsawad S., Poovorawan Y., Enterovirus A71 Infection, Thailand, 2017, Emerg. Infect. Dis., 2018, 24(7):1386-1387.
5. Thoa Le P. K., Chiang P. S., Khanh T. H., Luo S. T., Dan T. N., Wang Y. F., Thuong T. C., Chung W. Y., Hung N. T., Wang J. R., Nhan Le N. T., Thinh Le Q., Su I. J., Dung T. D., Lee M. S., Genetic and antigenic characterization of enterovirus 71 in Ho Chi Minh City, Vietnam, PLoS One, 2013, 8(7):1-6.
6. Nix W. A., Oberste M. S., Pallansch M. A., Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens, J. Clin. Microbiol., 2006, 44:2698-2704.
7. Голицына Л. Н., Патент № 2743352 Российская Федерация, Способ дифференциальной амплификации фрагмента области VP1 генома энтеровирусов видов Enterovirus A и Enterovirus B, № 2020117726: заявл. 19.05.2020: опубл. 17.02.2021, Правообладатель ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора, Бюллетень ФИПС «Изобретения. Полезные модели», 2021 г., № 5.
8. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S., MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods, Mol. Biol. Evol., 2011, 28:273-2739.
9. Drummond A. J., Suchard M. A., Xie D., Rambaut A., Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7., Mol. Biol. Evol., 2012, 29(8):1969-73.
10. Голицына Л. Н., Зверев В. В., Парфенова О. В., Епифанова Н. В., Сашина Т. А., Кашников А. Ю., Григорьева Г. И., Новикова Н. А., Вирус Коксаки А6 в Российской Федерации в 2014 году, Дальневосточный журнал инфекционной патологии, 2015, 28:12-20.
11. Anh N. T., Nhu L. N. T., Van H. M. T., Hong N. T. T, Than T. T., Hang V. T. T., Ny N. T. H., Nguyet L. A., Phuong T. T. L., Nhan L. N. T., Hung N. T., Khan T. H., Tuan H. M., Viet H. L., Nam N. T., Viet D. C., Qui P. T., Wills B., Sabanathan S., Chau N. V. V., Thwaites L., Van Doorn H. R., Thwaites G., Rabaa M. A., Tan L. V., Emerging Coxsackievirus A6 causing hand foot and mouth disease, Vietnam, Emerg. Infect. Dis., 2018, 24(4):654-661.
12. Hoa-Tran T. N., Dao A. T. H., Nguyen A. T., Kataoka C., Takemura T., Pham C. H., Vu H. M., Hong T. T. T., Ha N. T. V., Duong T. N., Thanh N. T. H., Shimizu H., Coxsackieviruses A6 and A16 associated with hand, foot, and mouth disease in Vietnam, 2008-2017: Essential information for rational vaccine design, Vaccine, 2020, 38(52):8273-8285.
13. Голицына Л. Н., Зверев В. В., Пономарева Н. В., Романенкова Н. И., Нгуен Т. Т. Т., Канаева О. И., Селиванова С. Г., Леонов А. В., Розаева Н. Р., Кашников А. Ю., Бичурина М. А., Новикова Н. А., Молекулярно-эпидемиологический мониторинг циркуляции вируса Коксаки А10, Здоровье населения и среда обитания, 2021 г., 4(337):43-49.
14. Romanenkova L. N. Golitsyna T. T. T. Nguyen N. V., Ponomareva, A. V. Leonov, O. I. Kanaeva, V. V. Zverev, S. G. Selivanova, N. R. Rozaeva, M. A. Bichurina, N.A. Novikova, Epidemiological and etiological aspects of enterovirus infection in Russia and Vietnam, Инфекция и Иммунитет, 2021, 11(5):895-908.
15. Puenpa J., et al., Hand, foot, and mouth disease caused by coxsackievirus A6, Thailand 2012, Emerg. Infect. Dis. 2013, 19(4):641-643.