ỨNG DỤNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ GEN PHÁT HIỆN Rickettsia GÂY BỆNH SỐT NỔI MỤN (Rickettsia SFG) TỪ MẪU NGOẠI KÝ SINH THU THẬP TẠI HÀ GIANG
Viện Y sinh Nhiệt đới, Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga
Số 63 Nguyễn Văn Huyên, Nghĩa Đô, Cầu Giấy, Hà Nội
Số điện thoại: 0963122607; Email: leanhbio@gmail.com
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
APPLICATION OF GENE SEQUENCING METHOD TO DETECT Rickettsia SPOTTED FEVER GROUP FROM ECTOPARASITES COLLECTED IN HA GIANG
Rickettsiosis is a zoonotic disease caused by Rickettsiae which are gram negative bacteria, obligate intracellular. These pathogens are transmitted to human through infected ticks, mites, fleas, lice, louse… In this study, The 17kDa and OmpA partial genes of Rickettsia were amplified to detect Rickettsial DNA in buffalo ticks and louse (Haematopinus tuberculatus) collected in Ha Giang province. The PCR products were sequenced, analyzed and build phylogenetic tree by Bioedit, Mega-X softwares; were compared and identified the reference strain sequences by BLAST- NCBI, USA. The results indicated that 14/25 tick samples and 2/14 louse samples were positive for Rickettsia SFG by PCR. Sequence analysis of OmpA gen showed that 14 clone isolated from the tick samples exhibites a 98% - 100% similarity to Rickettsia japonica, whereas 2 clone isolated from the louse samples were 98% similar to Rickettsia massiliae. Thus, our research showed that Rickettsia SFG including Rickettsia japonica and Rickettsia massiliae were detected in ticks and louse, respectively collected in Ha Giang province, Vietnam.
Từ khóa
Spotted fever, Rickettsia, Rickettsia japonica, Rickettsia massiliae, buffalo louse, tick, sốt nổi mụn, rận trâu, ve trâu
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
2. Parola P., Paddock C. D., Socolovschi C., Labruna M. B., Mediannikov O., Kernif T., Abdad M. Y., Stenos J., Bitam I., Fournier P. E., Raoult D., Update on tick-borne rickettsioses around the world: a geographic approach, Clin. Microbiol. Rev., 2013, 26(4):657-702.
3. Lê Thị Lan Anh, Võ Viết Cường, Trịnh Văn Toàn, Hồ Thị Hồng Nhung, Lê Thị Vân Anh, Cấn ThịThu Thủy, Phạm Thị Hà Giang, Bùi Thị Thanh Nga, Bùi Thị Lan Anh, Nguyễn Văn Châu, Phát hiện DNA của vi khuẩn Rickettsia và Orientia Tsutsugamushi trên động vật gặm nhấm và ngoại kí sinh trùng ở Hà Giang, Tạp chí Công nghệ Sinh học, 2020, 18(3):543-552.
4. Regnery R. L., Spruill C. L., Plikaytis B. D., Genotypic identification of rickettsiae and estimation of intraspecies sequence divergence for portions of two rickettsial genes, J. Bacteriol., 1991, 173(5):1576-89.
5. Noh Y., Lee Y. S., Kim H. C., Chong S. T., Klein T. A., Jiang J., Richards A. L., Lee H. K., Kim S. Y., Molecular detection of Rickettsia species in ticks collected from the southwestern provinces of the Republic of Korea, Parasites & Vectors., 2017, 10(1):20-30.
6. Thu M. J., Qiu Y., Matsuno K., Kajihara M., Mori-Kajihara A., Omori R., Monma N., Chiba K., Seto J., Gokuden M., Andoh M., Oosako H., Katakura K., Takada A., Sugimoto C., Isoda N., Nakao R., Diversity of spotted fever group rickettsiae and their association with host ticks in Japan, Sci. Rep., 2019, 9(1):1500.
7. Schötta A. M., Wijnveld M., Höss D., Stanek G., Stockinger H., Markowicz M., Identification and characterization of "Candidatus Rickettsia thierseensis", a novel spotted fever group Rickettsia species detected in Austria, Microorganisms, 2020, 8(11):1670.
8. Song S., Chen C., Yang M., Zhao S., Wang B., Hornok S., Makhatov B., Rizabek K., Wang Y., Diversity of Rickettsia species in border regions of northwestern China, Parasites & Vectors, 2018, 11(1):634.
9. Gaowa, Ohashi N., Aochi M., Wuritu D., Wu, Yoshikawa Y., Kawamori F., Honda T., Fujita H., Takada N., Oikawa Y., Kawabata H., Ando S., Kishimoto T., Rickettsiae in ticks, Japan, 2007-2011, Emerg. Infect. Dis., 2013, 19(2):338-40.
10. Seo M. G., Kwon O. D., Kwak D., Molecular and phylogenetic analysis of tick-borne pathogens in ticks parasitizing native Korean goats (Capra hircus coreanae) in South Korea, Pathogens, 2020, 9(2):71.
11. Qin X. R., Han H. J., Han F. J., Zhao F. M., Zhang Z. T., Xue Z. F., Ma D. Q., Qi R., Zhao M., Wang L. J., Zhao L., Yu H., Liu J. W., Yu X. J., Rickettsia japonica and novel Rickettsia species in ticks, China, Emerg. Infect. Dis., 2019, 25(5):992-995.
12. Olivieri E., Wijnveld M., Bonga M., Berger L., Manfredi M. T., Veronesi F., Jongejan F., Transmission of Rickettsia raoultii and Rickettsia massiliae DNA by Dermacentor reticulatus and Rhipicephalus sanguineus (s.l.) ticks during artificial feeding, Parasites & Vectors, 2018, 11(1):494.
13. Lu Q., Yu J., Yu L., Zhang Y., Chen Y., Lin M., Fang X., Rickettsia japonica infections in humans, Zhejiang Province, China, 2015, Emerg. Infect. Dis., 2018, 24(11):2077-2079.
14. Wei Q. Q., Guo L. P., Wang A. D., Mu L. M., Zhang K., Chen C. F., Zhang W. J., Wang Y. Z., The first detection of Rickettsia aeschlimannii and Rickettsia massiliae in Rhipicephalus turanicus ticks, in northwest China, Parasites & Vectors, 2015, 10(8):631.
15. Satjanadumrong J., Robinson M. T., Hughes T., Blacksell S. D., Distribution and ecological drivers of spotted fever group Rickettsia in Asia, Ecohealth., 2019, 16(4):611-626.